目前，野生冬虫夏草最早开始采挖的区域是云南省迪庆藏族自治区（“香格里拉”）、怒江傈僳族自治州、丽江地区，贵州省地区，甘肃省甘南藏族自治州，西藏自治区日喀则地区所属的吉隆区和页当区、东县的上亚东区和下亚东区、聂拉木的樟东区、定日县的绒辖区、定结的陈塘区，青海省黄南藏族自治州、海南藏族自治州、海北藏族自治州等;其后是四川省甘孜藏族自治州、阿坝藏族羌族自治州;再晚的是西藏自治区昌都地区和青海省果洛藏族自治州两地;最晚的是青海省玉树藏族自治州和西藏自治区那曲地区(那曲藏语意为“黑河”)两地。
采挖期，最好到海拔3000—5500米左右的向阳潮湿、土质松软肥沃的山坡、草甸、灌木丛下,弯腰或者趴在地上仔细观察，沿坡地向上寻找，发现有冬虫夏草子座(俗称草头)后，使用铁锹在距离草头7厘米左右，（注意：太近或太远都容易挖断虫体，也不可用手直接拨草头采挖，）连草皮深挖9厘米左右，取出冬虫夏草。因冬虫夏草分布一般比较集中，所以附近可能还有冬虫夏草，当地同胞称为虫草窝子，25天内，会有新的冬虫夏草在此范围生出子座（俗称草头），日后可留意耐心仔细的寻找，密集处一平方米内可发现冬虫夏草6至22条左右。
冬虫夏草采挖后，为保护环境，所挖的坑要做处理，不给鼠类创造好的筑窝条件。为进一步防止草场退化和水土流失，减少对自然环境的破坏度，因此，请你把裸露的泥土上的原植被放回原处。采挖过程中，如果折断了虫体，一般来说应用小木签或草签把虫体再穿起来,因为目前冬虫夏草产地收购价格，多是依具个体大小和条数为准。断了的冬虫夏草的百分比收购计算价，一般会产生争议。
冬虫夏草的最佳采挖期，最准确的预计方法主要为依据当时和往年同期天气冷暖对比情况。在最佳采挖时间采挖，不但虫体充实饱满、肥壮，草头短，且易于发现和采挖。采量、质量、药效相比之下都要高。如果过早采挖，多数草头还末出土，不易寻找和采挖，过晚采挖则藏虫草干枯，虫体空心或腐烂。
以前当地藏族同胞比较迷信,认为冬虫夏草是山神的肠子，所以很多藏族同胞是不挖的，去挖它的主要是外地人。随着科学知识的逐步普及，现在当地藏族同胞大部分也有采挖，但在某些地区，当地藏族同胞多数仍是不采挖冬虫夏草，否则就要受到乡亲的指责。现在冬虫夏草已不象过去那样多了，其结果可能与这几年大量采挖、环境保护不够和自然气候有关。
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